12月17日上午，在由科技部、中科院和北京市政府在北京会议中心联合召开的“2009年中关村国家自主创新示范区百家创新型企业试点工作大会”上，包括北京碧水源科技股份有限公司在内的首批56家企业被列为中关村国家自主创新示范区创新型企业。 中共中央政治局委员、北京市委书记刘淇，市委副书记、市长郭金龙，市委常委赵凤桐，副市长苟仲文，科技部党组书记、副部长李学勇，中科院常务副院长白春礼，副秘书长何岩等领导出席了大会并讲话。科技部、中科院及北京市有关单位、园区创新型试点企业代表等共1000余人参加本次大会。出席会议的领导还为第三批试点企业和首批自主创新型企业代表授牌。北京碧水源公司总经理文剑平作为首批自主创新型企业代表从刘淇书记手中接过牌匾。
自2007年进入第一批试点企业以来，北京碧水源公司加大自主创新的力度，积极响应国家和上级各部门有关自主创新建设的方针政策、宗旨和精神，建立健全创新体制、机制，构建自主创新模式，加快科技成果产业化和产业基地建设，在自主创新的道路上迈出了一大步。此次被授予“首批中关村国家自主创新示范区创新型企业”则是对碧水源全面自主创新工作取得突出成效的高度肯定。
在今后的工作中，公司将把刘淇书记的“要培育一批世界一流的创新型企业，进一步优化发展环境；要以建设产业基地、发展产业集群为方向，支持领军企业做强做大，在战略性新兴产业中，形成一批具有国际影响力的高技术大公司”的讲话精神落实到实处，继续走自主创新之路，通过多种模式整合产业资源，进一步加快国际化步伐，迅速做强做大，使北京碧水源公司成为全球有影响力的污水资源化高科技企业。
